Safe Harbor 基因敲入試劑盒及敲入克隆
通過在染色體上的特定位點插入目的基因和其他遺傳因子,對基因組進行改造——這項實驗在細胞工程上具有極大的價值。經(jīng)過基因改造的細胞在醫(yī)學研究、基因功能研究及族系跟蹤和分析中扮演著重要的角色。而所有這些應(yīng)用都取決于轉(zhuǎn)入基因功能的可靠性和可預(yù)測性,同時需要轉(zhuǎn)入基因不擾亂內(nèi)源基因和/或其他調(diào)控因子的功能。相反,隨機整合的轉(zhuǎn)入基因會帶來不可預(yù)知的插入或突變,構(gòu)成威脅。
今年發(fā)展的新實驗方法是將基因轉(zhuǎn)入基因組上一個已知的安全位點。人類第19號染色體上的 AAVS1(又名為 PPP1R2C 位點)或者小鼠基因組上的 ROSA26 就是這種經(jīng)過驗證的“安全港”位點。它們具有開放的染色質(zhì)結(jié)構(gòu),能保證轉(zhuǎn)入基因片段的功能。最重要的是,在這些位點插入外源基因片段對細胞無已知的副作用。
特異靶向 safe harbor 位點的 TALEN 或 CRISPR-Cas9 能在基因組的 safe harbor 位點上生成 DNA 雙鏈斷裂(DSB),誘發(fā) DNA 的自然修復(fù)機制,促使該位點與對應(yīng)的 ORF 敲入克隆之間發(fā)生同源重組(HR)(圖1),將 ORF 敲入克隆上的 DNA 片段整合到基因組的 safe harbor 位點。
圖1. 基因組編輯工具介導的 safe harbor 基因敲入原理圖
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